Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Vmn1r34G3XA52 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vmn1r34G3XA52 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms