Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
BC067074F6RXI4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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BC067074F6RXI4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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BC067074F6RXI4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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BC067074F6RXI4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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BC067074F6RXI4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
BC067074F6RXI4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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