Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm340F6RGI3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm340F6RGI3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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