Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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