Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
E430018J23RikE9PZQ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E430018J23RikE9PZQ8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms