Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sbf2E9PXF8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms