Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde2E9PUP1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms