Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx8D3YU81 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms