Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cttnbp2B9EJA2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms