Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Clip3B9EHT4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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