Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ssxb8B1AY40 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ssxb8B1AY40 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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