Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trabd2bB1ATG9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trabd2bB1ATG9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trabd2bB1ATG9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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