Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spocd1B1ASB6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spocd1B1ASB6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms