Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M5A7VMS3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M5A7VMS3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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