Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms