Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms