Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syndig1A2ANU3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms