Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ambra1A2AH22 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ambra1A2AH22 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms