Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms