Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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