Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Knop1Q9Z2Q2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms