Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Crlf3Q9Z2L7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Crlf3Q9Z2L7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Crlf3Q9Z2L7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Crlf3Q9Z2L7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms