Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms