Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms