Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psma1Q9R1P4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psma1Q9R1P4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms