Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Plod3Q9R0E1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms