Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gpc6Q9R087 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gpc6Q9R087 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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