Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms