Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms