Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Six6Q9QZ28 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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