Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms