Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ChmQ9QXG2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmQ9QXG2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms