Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limd1Q9QXD8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms