Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer2Q9QWW1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms