Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdcQ9QW08 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms