Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dkk3Q9QUN9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dkk3Q9QUN9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms