Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hmgn5Q9JL35 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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