Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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SelenofQ9ERR7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SelenofQ9ERR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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