Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms