Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SgshQ9EQ08 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms