Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syde1Q9DBZ9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms