Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Smg9Q9DB90 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg9Q9DB90 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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