Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prpf4Q9DAW6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms