Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnpy3Q9DAU1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms