Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sgf29Q9DA08 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sgf29Q9DA08 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms