Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc103Q9D9P2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc103Q9D9P2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms