Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf138rt1Q9D9M9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf138rt1Q9D9M9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms