Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx5Q9D8U8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms