Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capn9Q9D805 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn9Q9D805 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms