Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Echdc3Q9D7J9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Echdc3Q9D7J9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms